Optimisation of Xenium automated in situ sequencing for PAXgene-fixed tissue samples
Deze studie presenteert een geoptimaliseerde werkstroom met behulp van een nieuw pepsine-gebaseerd digestieprotocol (XTO) om het Xenium-geautomatiseerde in situ-sequencingplatform succesvol aan te passen voor PAXgene-gefixeerd weefsel, en toont aan dat deze monsters ruimtelijke RNA-transcriptdetectie kunnen bereiken die vergelijkbaar is met of superieur is aan standaard FFPE-monsters, terwijl de weefselmorfologie behouden blijft.